Hatte das auch gerade. Nach Durchlesen des Manuals und Suche in diversen Typo3-Foren fand ich heraus, daß es nicht ausreicht, die Konfiguration "typical" zu wählen, da diese immer noch zu restriktiv ist.
Du mußt, wohl oder übel, den RTE konfigurieren.
Und zwar jeweils die Datei pagetsconfig.txt im Unterordner /res/proc und /res/typical.
Dort habe ich dann z.B. alles entfernt, was nach "don't allow" aussah. Nun kann ich zumindest schon mal <p class=".."> machen und Styles verwenden, aber <span> Formatierungen löscht er immer noch...