Dein Stylesheet wird nicht überschrieben, sondern deins überschreibt das Standard Stylesheet von Typo3. Als kleine Information, In dem generierten Stylesheet das zuerst inkludiert wird stehen Standard Stylesheet Angaben von Typo3 und Extensions drin.
Code:
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="typo3temp/stylesheet_1cffeed18b.css" />
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="fileadmin/style.css" />
http://www.typo3forum.net/forum/typo...head-fuer.html